Ein internationales Forschungsteam hat „Nemos“ Genom kartiert und der wissenschaftlichen Gemeinschaft eine unschätzbare Informationsquelle geliefert, um die Reaktionen von Fischen auf Umweltveränderungen zu entschlüsseln, den Klimawandel eingeschlossen.
In einer bahnbrechenden Studie unter Leitung der King Abdullah University of Science and Technology (KAUST) und des ARC Centre of Excellence for Coral Reef Studies (Coral CoE) nutzten Forscher moderne Sequenzierungswerkzeuge, um eine der vollständigsten genetischen Karten des Echten Clownfischs zu erstellen. Der Echte Clownfisch ist ein häufig vorkommender Riffbewohner und spielt die Hauptrolle in dem Disney-Film „Findet Nemo“.
„Dieses Genom gibt einen grundlegenden Bauplan, um jeden Aspekt der Biologie von riffbewohnenden Fischen zu verstehen“, sagte der Hauptautor Dr. Robert Lehman von der KAUST in Saudi-Arabien. „Er enthält 26.597 proteincodierende Gene. Und wie das weltgrößte Puzzle waren Geduld und Zeit erforderlich, um es zusammenzusetzen.“ Der Echte Clownfisch (Amphiprion percula) ist nicht nur der bekannteste Riffbewohner auf der Erde, sondern auch einer der am besten untersuchten.
„Diese Spezies ist wichtig für bahnbrechende Forschungen bezüglich der ökologischen, umweltbedingten und evolutionären Aspekte von riffbewohnenden Fischen“, sagte der Co-Autor Professor Philip Munday vom Coral CoE an der James Cook University in Australien. „Beispielsweise ist der Clownfisch ein Modell für die Untersuchung des Geschlechtswechsels bei Fischen. Er hat uns auch geholfen, die Ausbreitungsmuster der Larven von riffbewohnenden Fischen zu verstehen. Und sie ist die erste Fischspezies, bei der nachgewiesen werden konnte, dass das Meidungsverhalten gegenüber Raubtieren durch die Versauerung der Ozeane beeinträchtigt werden könnte.“
Das Team nutzte moderne Technologien, um das Genom des Clownfischs zu sequenzieren. Ihre Gen- und Transkribierungsdaten sind jetzt in der Nemo Genome DB Datenbank verfügbar. „Der Clownfisch umfasst annähernd 939 Millionen Nukleotide, die zueinander passen müssen“, sagte der Co-Autor Professor Timothy Ravasi von der KAUST. „Das ist eine extrem wertvolle Informationsquelle für die wissenschaftliche Gemeinschaft und wird den Echten Clownfisch als ideales Objekt für genetische Studien weiter etablieren.“
„Dies ist eines der vollständigsten Fischgenome, die jemals erstellt wurden“, sagte der Co-Autor Professor David Miller vom Coral CoE an der James Cook University. „Die Verwendung der PacBio-Einzelmolekül-Echtzeitsequenzierungstechnologie ermöglichte uns, ein glänzendes Ergebnis zu erzielen.“
Die Abhandlung mit dem Titel „Finding Nemo’s Genes: A chromosome-scale reference assembly of the genome of the organge clownfish, Amhiprion percula“ erschien am 10. September 2018 im Journal Molecular Ecology Resources.
(THK)
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